Dalam rangka meningkatkanmutu proses belajar mengajar baik bagi para mahasiswa maupun dosen, maka Fakultas Pertanianmenjalin kerjasama dengan beberapa instansi pemerintah maupun swasta. Beberapa kerjasama yang telah terjalin adalah sebagai berikut ini.
- BLKPPTKLN Wonojati-Malang untuk kegiatan Praktik Kerja Lapang (PKL) dan penelitian mahasiswa.
- Gabungan Kelompok Tani (Gapoktan) “Mulyo Santoso”yang bergerak di bidang agribisnis dan pengolahan sayuran organik.
- Unika Soegijapranata Semarang; di bidang pendidikan dan pengajaran dalam kegiatan Service Learning untuk menunjang mata kuliah Sistem Pertanian Organik.
- Beberapa industri pengolahan hasil pertanian yaitu PT Agar-agar Srigunting, Puspa Florist Malang dan Kripik Buah-buahan “Maniez” Malang untuk studi lapang, PKL dan penelitian mahasiswa.
Kerjasama di tingkat UKWK Malang yang juga terkait dengan Fakultas Pertanian adalah sebagai berikut ini.
- Dinas Perindustrian Perdagangan Koperasi (Dissperindagkop) Kota Malang, di bidang pengabdian kepada masyarakat.
- Microsoft Campus Agreement (MCA), di bidang lisensi software legal.
- Citra Media Solusindo Malang, di bidang pengembangan Teknologi Informasi dan Komunikasi (TIK), terutama dalam akses internet. Hal ini juga semakin membuka lebar peluang kerjasama di bidang multimedia guna meningkatkan kemampuan civitas academica dalam TIK.
- SMAK Frateran Malang dan SMAK Kolose Santo Yusuf Malang, di bidang penerimaan dan seleksi mahasiswa baru.
- Carmel Vision Entertainment Malang, di bidang promosi.
- The University of San Carlos, Cebu – Philippines, di bidang pertukaran mahasiswa, pertukaran dosen untuk kegiatan pendidikan dan pengajaran, serta penelitian, dan kolaborasi dalam proyek-proyek penelitian.
- PT. Bank Danamon Indonesia, Tbk., di bidang pendidikan dan pengajaran dengan kegiatan seminar, kuliah tamu, dan magang mahasiswa, serta penyaluran lulusan.